原告薛良判处死刑，为他作证的证人全部戍边，张寅官复原职。马录陷人死罪但未得逞，判处徒刑。其他涉及此案被处理的各级官员有四十余人。
谪戍边疆，终生不赦的五人：前山西布政使李璋、按察使李珏、佥事章纶、都指挥马豸、前山西副使改任大理少卿的文华；谪戍边境卫所的七人：给事中刘琦、张逵、常泰，御史卢琼、程启充，刑部郎中刘仕及知州胡伟。
削职为民的十一人：左都御史聂贤，给事中王科、郑一鹏、沈汉、程辂，御史高世魁、任淳，南京御史姚鸣凤，郎中司马相，评事杜鸾。
革职赋闲的十七人：刑部尚书颜颐寿，侍郎刘玉、王启，山西巡抚江潮，副都御史刘文庄，大理卿汤沐，大理少卿顾学，大理寺丞汪渊，太仆卿汪元锡，光禄少卿余才，工部侍郎闵楷，都御史张仲贤、佥都御史张润，御史张英，南京御史潘杜、戚雄，由大理寺丞改任佥都御史的毛伯温。
尚书、侍郎级的高官甚至比左顺门之变牵连的更加多，成为嘉靖初年的大案之一。
所有本朝一旦涉及白莲教，都是极为慎重的，即便像陆炳这样极得嘉靖信任的臣子，也要非常小心谨慎，免得触碰到嘉靖的逆鳞，遭到反噬。
所以陆炳建议道：“殿下，此案尚未审明查实，是否是白莲妖人所为，尚无实证，殿下也不必先下定论，免得落人以把柄。”
虽然此案已经过去近三十年了，但是谁也不知道当年的旧案会不会被翻出来，这么多年以来，一直有官员想将此案翻过来，尤其是郭勋死后，更是是不是有言官上疏要求重审此案，以此反攻倒算大礼议。
对于言官们的小心思，嘉靖洞若观火，谁敢翻此案，都会遭到嘉靖的严厉打击。嘉靖已经将此案和大礼议联系在一起了，所以在本朝，任何有关白莲教的案子，都会引起嘉靖的高度警惕，就是怕有人借机翻案。
陆炳也是出于这个道理，所以才劝朱载坖先不要将此案往白莲妖人上牵连，免得被嘉靖猜疑。